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我科研人員發(fā)現(xiàn)接近完整的白菜基因組
2023-02-18 10:52:30來源: 工人日?qǐng)?bào)客戶端


(資料圖片僅供參考)

工人日?qǐng)?bào)-中工網(wǎng)記者 黃哲雯 通訊員 陳旭

記者從中國農(nóng)科院獲悉 ,近日,該院的蔬菜花卉研究所分子育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)研究獲得接近完整組裝的白菜基因組,揭示白菜著絲粒的快速進(jìn)化特征。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《植物生物技術(shù)(Plant Biotechnology Journal)》上。

白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一,是我國栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個(gè)完成基因組測序的物種,白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎(chǔ)。但是,目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個(gè)缺口,其10條染色體的著絲粒結(jié)構(gòu)組裝均不完整。

據(jù)介紹,該團(tuán)隊(duì)利用三代測序技術(shù),獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補(bǔ)了白菜基因組中絕大多數(shù)缺口,完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝,僅有2條染色體仍存在一個(gè)缺口;該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。

研究還發(fā)現(xiàn),著絲粒區(qū)域長末端重復(fù)序列的平均插入時(shí)間為14萬年,顯著晚于泛著絲粒區(qū)域,表明白菜的著絲粒區(qū)域經(jīng)歷著快速進(jìn)化。

該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目等項(xiàng)目的支持。

關(guān)鍵詞: 快速進(jìn)化 栽培面積 長末端重復(fù)序列

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